车贷存入银行卡中，系统没有发起自动扣款，通常是因为还没有到系统自动扣款的时间。虽然说，系统会在车贷还款日当天24点之前发起自动扣款，但是这个扣款时间是相对固定的。如果用户前几次扣款时间都是上午8点，那么在8点之前，系统大概率是不会发起自动扣款的。另外，如果用户确实已经将还款资金存入银行卡中，而还款日当天系统都没有发起自动扣款，那么可能是扣款系统出了问题，这时候用户需要主动还款避免车贷逾期。扣款系统虽然极少出现故障，但是也不排除会因特殊原因而导致没有按时扣款。在固定的时间内，系统没有发起自动扣款，这时候用户就可以准备手动还款了。只要用户按时还款，贷款机构不会追究用户是自动还款还是手动还款。