实践中主要有以下情形：先裁决后取证；未告之相对人相关权利；应当回避却没有回避；超时限询问查证，刑讯逼供；非法搜查；钓鱼取证；只有一名执法人员调查取得的证据；执法人员未取得相应执法资格；采取偷拍、偷录、窃听等手段且取侵害他人合法权益；采取利诱、欺诈、胁迫、暴力等不正当手段。

（一）首先该鉴定必须要得到法院的认可，认为其实审理中的关键证据，法院才会接受你的鉴定申请；

（二）将检材与样材提交至法院，法院会将原被告双方都认可的样本连同检材送至随机抽取或双方都无异议的司法鉴定所；

（三）司法鉴定所做出结果后直接返回法院。这里送送检材料必须是双方当事人都认可的，如你所说，笔迹材料是在法院书写的，如双方当事人已经认可该送检材料，其鉴定程序和材料在没有其他足以推反的情况，鉴定结果是有效的。无需当事人在鉴定现场。

根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第二十七条规定：当事人对人民法院委托的鉴定部门作出的鉴定结论有异议申请重新鉴定，提出证据证明存在以下情形之一的，人民法院应予准许：鉴定机构或者鉴定人员不具备相关的鉴定资格的；鉴定程序严重违法的；鉴定结论明显依据不足的；经过质证认定不能作为证据使用的其他情形。对有缺陷的鉴定结论，可以通过补充鉴定、重新质证或者补充质证等方法解决的，不予重新鉴定。

综上所述，根据法律的相关的规定，当事人申请鉴定经人民法院同意后?由双方当事人协商确定有鉴定资格的鉴定机构、鉴定人员协商不成的由人民法院指定。此内容仅供参考。以上就是找法网的小编为您带来的关于鉴定意见程序违法的情形，若大家有什么不了解的或者其他疑问可以咨询找法网的律师。