用人单位不违法，不用怕员工申请劳动仲裁。用人单位与劳动者之间存在劳动争议，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。申请人申请仲裁应当提交书面仲裁申请，并按照被申请人人数提交副本。

企业的性质可以分为：全民所有制企业（即国有企业）、集体所有制企业、联营企业、三资企业、私营企业及其他企业。公司种类又分为有限责任公司和股份有限公司两种，其中有限责任公司又分为国有独资公司和非国有独资公司。从广义上讲，国有公司以出资情况来加以区分，可以分为国有独资公司、国有控股公司和国有参股公司。一人有限公司是指只有一名自然人股东组成的公司，其最低注册资本十万，也是有限责任公司里的一种特殊形式。国有独资公司，是指由国家单独投资组建的公司，也是有限责任公司中的一种，也称国有企业。有限责任公司，是指由两名以上五十名以下自然人股东组成，最低注册资本三万元。股份有限公司是指由募集组建的公司，其最低注册资本五百万元。以上公司都具有法人资格。中外合资企业，是指由中方与外方按一定的比例共同出资组建的企业。中外合作企业，是指中方与外方共同合作经营的企业；外商独资企业是指由外商单独投资组建的企业。合伙企业，是指由两名以上自然人合伙开办，对外承担无限责任的企业。个人独资企业，是指由一个自然人投资设立，对外承担无限责任的企业。以上企业不具有法人资格。《公司法》第二条 调整对象本法所称公司是指依照本法在中国境内设立的有限责任公司和股份有限公司。

可以通过诉讼方式讨回。依据《劳动争议调解仲裁法》第五十条，当事人对发生法律效力的调解书、裁决书，应当依照规定的期限履行。一方当事人逾期不履行的，另一方当事人可以依照民事诉讼法的有关规定向人民法院申请执行。受理申请的人民法院应当依法执行。

综上所述可知，只要用人单位不违法，不用怕员工申请劳动仲裁，仲裁裁决会采取公正客观立场的。以上是找法网编辑对申请劳动仲裁单位害怕吗的介绍，希望对您有帮助。如果您不懂如何起诉，可以咨询找法网律师，他们会给您专业的建议。